README del modulo
01 Datos sinteticos AMR
Genera y valida datos ficticios de microbiologia para tres nodos hospitalarios simulados.
Cada nodo tiene un volumen y perfil epidemiologico distinto para evitar una demo artificialmente simetrica. La generacion usa una semilla fija para ser reproducible, pero no produce exactamente el mismo numero de filas por nodo.
Los datos incluyen:
- Patogeno AMR prioritario.
- Antibiotico.
- MIC sintetica.
- Interpretacion resistente/sensible.
- Mecanismo de resistencia ficticio.
- Contexto clinico minimo agregado.
- Indicador de genomica disponible.
No hay pacientes reales, identificadores reales ni datos del ENDS.
Ejecutar
Desde Desarrollo:
python .\01_datos_sinteticos_amr\generar_dataset_sintetico.py
python .\01_datos_sinteticos_amr\validar_calidad.py
Salidas
salida/nodos/*.csv: un CSV por nodo simulado.salida/manifest.json: resumen de generacion.
Perfiles simulados
- Madrid Norte: mas peso CRE y mayor presion carbapenemica.
- Barcelona Mar: mayor volumen y mas disponibilidad genomica.
- Valencia Turia: mas CRPA, mayor UCI simulada y mayor desplazamiento de resistencia.
Estos perfiles son pedagogicos; no representan hospitales reales.